Listes de logiciels libres pour les SVT
Jeux
- jeu abordant l’histoire de Henrietta Lacks (Henrietta Lacks — Wikipédia). Free Art Licence 1.3
Pour le moment on a un premier niveau faisant office de tutoriel. L’histoire se déroule sur l’astéroïde HeLa, dont on dit dans le jeu qu’il est constitué de l’immense quantité de cellules de Henrietta Lacks ayant été reproduites. On contrôle deux personnages à la fois, tous les personnages présents dans le niveau peuvent être joués. Tous ont pour ressources communes des cellules et une barre de santé personnelle dépendant de ces cellules, on peut se soigner les uns les autres. Dans la deuxième partie de ce premier niveau on rencontre HeLa (qui est la déesse des lieux) une première fois, elle nous explique son histoire puis nous donne accès à un bouton pour lui demander son aide. Le jeu serait plutôt un jeu d’énigme, à chaque niveau il faut trouver la solution à un problème, mais les personnages ne peuvent pas tout faire seuls. Ils doivent demander l’aide de HeLa pour débloquer les situations, rendant ainsi le pouvoir à HeLa sur ses cellules. HeLa va pouvoir faire évoluer les corps des personnages, l’environnement ou encore le type de ses cellules…
- FoldIt Un jeu en ligne (pouvant aussi être joué en local) dans lequel les humains tentent de résoudre l'un des problèmes de calculs les plus difficile en biologie : le repliement des protéines.
Le jeu ne nécessite aucune connaissance particulière en biologie même si quelques connaissances aideront. La plupart des joueurs de Foldit sont des non biologistes.
- Thrive Un jeu libre sur le thème de l'évolution des espèces, du microbe à l'ère spatiale.
- Eterna Game
sciences participatives entre des gameuses, gameurs, des biologistes et des chimistes, pour concevoir, puis tester et étudier un nouveau ribosome
Via la plateforme jouable dans un navigateur ou Android ou IOS, genre puzzle
https://eternagame.org (Rapport chez @exodus : 2020 https://reports.exodus-privacy.eu.org/fr/reports/org.eternagame.mob/latest/ & 2021 https://reports.exodus-privacy.eu.org/fr/reports/198931 )
Jeu qui existe depuis 10 ans Eterna-mobile est sous BSD 3 clause license
« Le crowdsourcing de la conception d'ARNr permet d'obtenir des ribosomes mutants fonctionnels et de surpasser les prédictions computationnelles. (a) La conception de l'ARNr a été confiée à des scientifiques de la communauté (CS) via la plateforme Eterna ». Community science designed ribosomes with beneficial phenotypes, in Biorvix
Ce qui contribue à mieux comprendre les phénotypes, et formations, des ribosomes
Script
- BacillusMarker, python et licence MIT, est une application pour marquer facilement les bacilles de la tuberculose.
- ParasiteMarker, python et Licence MIT est une application permettant de marquer facilement les parasites du paludisme.
Dessin
- rna2drawer
Un étonnant programme de dessin de structures d'ARN !
Il propose des annotations détaillées, des bases d'appariement, des tiges pivot, des séquences d'ajout/soustraction, des couleurs par SHAPE, la recherche d'appariements alternatifs, etc., et des téléchargements en SVG ou PPT en tant qu'objets séparés.
Code source https://github.com/pzhaojohnson/rna2drawer2/blob/master/README.md libre sous licence MIT
Débats
- Logiciel BULLE INFINIE pour débattre en sciences (CC BY-NC-SA 2.0 FR) − Explications
